Для того, чтобы прекратить регистрацию гражданина по месту жительства в вашей квартире Вам необходимо обратиться в суд.
В суде Вам предстоит доказать, что этот гражданин фактически не проживает длительное время в квартире (это можно сделать при помощи свидетелей), не выполняет обязанности по оплате коммунальных услуг, проживает в другом месте.
По нижеприведенным ссылкам можно найти решения Верховного суда РФ, которые Вам могут помочь:
Для составления грамотного заявления и представления ваших интересов в суде рекомендуем обратиться за личной консультацией к квалифицированному адвокату или юристу.