Для того, чтобы осуществить государственную регистрацию прекращения деятельности в качестве индивидуального предпринимателя Вам необходимо выполнить действия приведенные здесь: http://vologda-expert.ru/sovety/story.php?id=10

В том числе получить справку в Пенсионном фонде РФ. Отказать в выдаче данной справки Вам не имеют права вне зависимости от размера вашей задолженности. Если Вам такую справку не выдают, данные действия можно оспорить в судебном порядке, а также написать жалобу в прокуратуру.

Что касается взносов во государственные внебюджетные фонды, то они взимаются в фиксированном размере вне зависимости от того, осуществляли ли Вы фактически предпринимательскую деятельность или нет. От уплаты данных взносов освобождаются только предприниматели за период, когда находились в отпуске по беременности и родам, а также осуществляли уход за ребенком до полутора лет.

Таким образом, можем порекомендовать Вам следующее:

1. как можно быстрее прекратить свою регистрацию в качестве индивидуального предпринимателя;

2. показать требования о взыскании с Вас задолженности по уплате взносов в государственные внебюджетные фонды квалифицированному юристу или адвокату, поскольку возможно Пенсионный фонд пропустил сроки взыскания данной задолженности за какие-то годы.